CO2培養箱主要用來培養細胞、組織和某些特殊微生物，為它們提供一個良好的體外培養環境，廣泛應用于細胞學實驗、微生物學實驗、組織學實驗以及分子生物學實驗。因此，CO2培養箱的清潔維護尤為重要。
 

　　進入CO2培養箱培養環境中，對細胞生存有害的成分和造成細胞不純的異物都應視為污染。不同的污染物對細胞的影響也有差別，有的影響是長期、緩慢和潛在的，而有的則能在很短的時間內抑制細胞生長或殺死細胞。根據污染源不同主要可以分為：生物性污染、化學性污染、物理性污染和氣溶膠污染。
 

　　1、生物性污染：這是最常見也是危害最大的污染。如細菌、病毒、真菌，支原體等。這些污染源有可能是人為帶入，或是細胞在放入二氧化碳培養箱前已經受污染，再或者是箱體本身沒有消毒干凈。體外培養的細胞自身沒有抵抗污染的能力，而培養基中所加抗生素的抗微生物污染的能力也是有限的，因而細胞微生物污染一旦發生往往是無法挽救的。
 

　　2、化學性污染：二氧化碳培養箱中許多化學物質都可以引起細胞污染。如細胞培養容器清洗過程中殘留的洗滌劑、加濕器中未純化的水、人為帶入的液體或氣體都可能成為化學性污染的來源。不同化學物質對細胞污染是不一樣的，有的可能促進或抑制細胞生長，有的甚至殺死細胞。
 

　　3、物理性污染：培養環境中的物理因素，如溫度、放射線、振動、輻射(紫外線或熒光)會對細胞產生影響。物理性污染常常被人們所忽視，其主要是在代謝水平或分子水平上，影響細胞正常的生理過程。
 

　　4、氣溶膠污染：氣溶膠是液體或固體微粒均勻地懸浮在氣體介質中的分散體系，當微粒是微生物時，就是微生物氣溶膠，如果這種微生物是病原性的，就是病原微生物氣溶膠。細菌、病毒等病原體通過氣溶膠可在人與人、人與環境之間傳播。